Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATP1B3P54709 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATP1B3P54709 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms