Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNB3P54284 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms