Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA3P52797 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms