Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RORCP51449 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RORCP51449 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RORCP51449 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RORCP51449 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RORCP51449 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RORCP51449 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RORCP51449 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RORCP51449 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RORCP51449 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RORCP51449 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RORCP51449 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RORCP51449 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RORCP51449 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RORCP51449 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RORCP51449 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RORCP51449 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RORCP51449 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms