Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERFP50548 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERFP50548 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERFP50548 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms