Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CEACAM6P40199 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms