Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GPC1P35052 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GPC1P35052 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GPC1P35052 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms