Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GCAP28676 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GCAP28676 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GCAP28676 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms