Protein–RNA interactions for Protein: P28335

HTR2C, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2CP28335 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR2CP28335 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HTR2CP28335 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms