Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTSSP25774 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTSSP25774 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTSSP25774 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms