Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRDP23468 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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