Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME2P23368 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ME2P23368 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ME2P23368 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ME2P23368 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ME2P23368 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ME2P23368 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms