Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DSPP15924 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DSPP15924 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DSPP15924 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DSPP15924 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DSPP15924 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms