Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG2P13521 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG2P13521 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG2P13521 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG2P13521 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCG2P13521 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCG2P13521 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCG2P13521 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCG2P13521 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCG2P13521 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCG2P13521 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCG2P13521 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCG2P13521 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms