Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IGHV1-8P0DP01 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IGHV1-8P0DP01 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms