Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2BP0DI82 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC2BP0DI82 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms