Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEFLP07196 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEFLP07196 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFLP07196 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFLP07196 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFLP07196 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFLP07196 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFLP07196 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFLP07196 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEFLP07196 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms