Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
F13BP05160 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
F13BP05160 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
F13BP05160 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
F13BP05160 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms