Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SFT2D2O95562 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms