Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOL3O95236 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOL3O95236 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOL3O95236 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOL3O95236 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms