Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATG12O94817 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATG12O94817 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms