Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SURF6O75683 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SURF6O75683 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SURF6O75683 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SURF6O75683 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SURF6O75683 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SURF6O75683 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SURF6O75683 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SURF6O75683 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms