Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KA4O75676 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KA4O75676 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms