Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NIPSNAP2O75323 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NIPSNAP2O75323 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms