Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms