Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CTIFO43310 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CTIFO43310 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CTIFO43310 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CTIFO43310 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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