Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPAA1O43292 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms