Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARPC1BO15143 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ARPC1BO15143 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms