Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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