Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms