Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQ87 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQ87 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQ87 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms