Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S1

TRPV2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV2Q9Y5S1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRPV2Q9Y5S1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRPV2Q9Y5S1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms