Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PAXBP1Q9Y5B6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms