Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAF6Q9Y4K3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRAF6Q9Y4K3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms