Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PLXND1Q9Y4D7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms