Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFE2L3Q9Y4A8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NFE2L3Q9Y4A8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms