Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CHTOPQ9Y3Y2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms