Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPS28Q9Y2Q9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms