Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SAMD4AQ9UPU9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms