Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
USP18Q9UMW8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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