Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERG28Q9UKR5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms