Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGA1Q9UJY5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms