Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VTI1BQ9UEU0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms