Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRP2BPQ9P2M1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms