Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAPAQ9P0L0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms