Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZDHHC3Q9NYG2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms