Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MS4A12Q9NXJ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms