Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SEMA4BQ9NPR2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms