Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TIMMDC1Q9NPL8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms