Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR2J2Q9GZM3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms